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La ficha 009-011-005 de la DFS, fechada el 27 de agosto de 1980, menciona la creación de un nuevo grupo armado conocido como el Ejército Zapatista de Liberación Nacional (EZLN) nacido de las Fuerzas de Liberación Nacional (FLN). La información de la DFS sobre la inminente aparición del EZLN se obtuvo de la reunión de las FLN en San Cristóbal de Las Casas el 6 de agosto de 1980.
El EZLN se fundó el 17 de noviembre de 1983 y se levantó en armas el 1 de enero de 1994, cuando el gobierno reveló la identidad de sus líderes, incluyendo al subcomandante Marcos y otros. Sin embargo, los delitos por los que fueron acusados prescribieron en 2016.
En documentos más antiguos de la DFS, se menciona a varios miembros de las FLN y su relación con el EZLN en 1980 y se confirma que las instancias de seguridad del gobierno de López Portillo estaban al tanto del brazo armado de las FLN que luego se llamaría EZLN.
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